Large Scale Computational Modelling of Cellular Biosystems

Widok

Metadane zasobu

Tytuł	Large Scale Computational Modelling of Cellular Biosystems Wariant tytułu: Wielkoskalowe obliczenia w matematycznym modelowaniu komórkowych układów biologicznych
Osoby	Autorzy: Maciej Wacław Cytowski Partner: Instytut Badań Systemowych PAN w Warszawie
Opis	Biological processes are inherently very complex and involve many unknown relationships and mechanisms at different scales. Despite many efforts, one still cannot explain all the observed phenomena nor, if necessary, make any desirable changes in their dynamics. Recently, it has become apparent that the opportunity lies in complementing the traditional, heuristic experimental approach with mathematical modelling and computer simulations. To obtain a simulation scale that corresponds, for instance, to clinically detectable tumour sizes is still a huge challenge, however, it is necessary to understand and control complex biological processes. In this thesis we present a novel large scale parallel computational model allowing 3-D simulations of cell colonies, growing and interacting with variable environment in previously unavailable tissue scale.The cells are modeled as individuals located in the lattice-free 3-D space. The model incorporates cellular environment, modelled in a continuous manner, as well as mathematical description based on partial differential equations, formulated for selected important components of the environment. Discrete and continuous formulations are efficiently coupled in one model and allow for consideration in different scales: sub-cellular, cellular and tissue scale. High parallel scalability achieved allows for simulation of up to 109 individual cells. This large scale computational approach allows for simulations to be carried out over realistic spatial scales up to 1cm in size i.e. the tissue scale. For the first time, a single model fills the gap between intracellular dynamics and the tissue. (Angielski)
Słowa kluczowe	"modelowanie matematyczne"@pl, "modelowanie matematyczne w biologii"@pl, "obliczenia równoległe"@pl, "metody agentowe"@pl
Klasyfikacja	Typ zasobu: praca dyplomowa Dyscyplina naukowa: dziedzina nauk technicznych / informatyka (2011) Grupa docelowa: naukowcy, studenci, przedsiębiorcy Szkodliwe treści: Nie
Charakterystyka	Miejsce powstania: Warszawa Czas powstania: 2014 Liczba stron: 96 Promotor: Marek Antoni Niezgódka Język zasobu: Angielski Lokalizacja: Warszawa
Licencja	CC BY-SA 4.0
Informacje techniczne	Deponujący: Justyna Kupczak Data udostępnienia: 26-10-2018
Kolekcje	Kolekcja Instytutu Badań Systemowych PAN w Warszawie, Kolekcja e-Biblio IBS PAN

Cytowanie

Skopiowano

Maciej Wacław Cytowski. Large Scale Computational Modelling of Cellular Biosystems. [praca dyplomowa] Dostępny w Atlasie Zasobów Otwartej Nauki, . Licencja: CC BY-SA 4.0, https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode.pl. Data dostępu: DD.MM.RRRR.

Podobne zasoby

Komputerowe wspomaganie decyzji w systemach gospodarki wodno-ściekowej. The use of mathematical models of the wastewater purification process for computer-aided decision making (RB-2000-46-06)

Jan Studziński, artykuł, rozdział, Instytut Badań Systemowych PAN w Warszawie, dziedzina nauk technicznych / inżynieria środowiska (2011)

Co mamy do powiedzenia specjalistom od gospodarki (RB-1994-93)

Jakub Gutenbaum, artykuł, rozdział, Instytut Badań Systemowych PAN w Warszawie, dziedzina nauk ekonomicznych / nauki o zarządzaniu (2011)

Water treatment technology: principles and modeling

Wojciech Adamski, Małgorzata Szlachta, książka, Politechnika Wrocławska, dziedzina nauk technicznych / inżynieria środowiska (2011)

Modelowanie matematyczne i eksperymentalna weryfikacja procesu impulsowego zagęszczania mas formierskich

Daniel Nowak, praca dyplomowa, Politechnika Wrocławska, dziedzina nauk technicznych / mechanika (2011)

Problemy obliczeń równoległych (PN-1988-14)

Ignacy Kaliszewski, Leon Słomiński, artykuł, rozdział, Instytut Badań Systemowych PAN w Warszawie, Dziedzina nauk ścisłych i przyrodniczych / informatyka (2018)

Dynamika zmian warunków wodnych w lasach na terenach polderowych - analiza interakcji

Alicja Krzemińska, książka, Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu, dziedzina nauk technicznych (2011)

Zobacz więcej